MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 78560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008345	CAA	2	6	41	46	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561189
2	NC_008345	CAGCA	2	10	75	84	40 %	0 %	20 %	40 %	114561189
3	NC_008345	TCCG	2	8	99	106	0 %	25 %	25 %	50 %	114561189
4	NC_008345	ATGG	2	8	119	126	25 %	25 %	50 %	0 %	114561189
5	NC_008345	T	6	6	206	211	0 %	100 %	0 %	0 %	114561189
6	NC_008345	ATT	2	6	371	376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561189
7	NC_008345	GCA	2	6	390	395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561189
8	NC_008345	AGC	2	6	457	462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561189
9	NC_008345	TGG	2	6	487	492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561189
10	NC_008345	GGC	2	6	518	523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561189
11	NC_008345	ATT	2	6	569	574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561189
12	NC_008345	AAT	2	6	578	583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561189
13	NC_008345	GTG	2	6	596	601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561189
14	NC_008345	GAA	2	6	662	667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561189
15	NC_008345	TTA	2	6	676	681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561189
16	NC_008345	TATT	2	8	699	706	25 %	75 %	0 %	0 %	114561189
17	NC_008345	T	6	6	719	724	0 %	100 %	0 %	0 %	114561189
18	NC_008345	AAG	2	6	744	749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561189
19	NC_008345	ATC	2	6	786	791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561189
20	NC_008345	ATT	2	6	794	799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561189
21	NC_008345	TTGG	2	8	861	868	0 %	50 %	50 %	0 %	114561189
22	NC_008345	AG	3	6	937	942	50 %	0 %	50 %	0 %	114561189
23	NC_008345	ACCT	2	8	951	958	25 %	25 %	0 %	50 %	114561189
24	NC_008345	ACGT	2	8	999	1006	25 %	25 %	25 %	25 %	114561189
25	NC_008345	TGCTAA	2	12	1036	1047	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	114561189
26	NC_008345	ATA	2	6	1134	1139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561189
27	NC_008345	AGA	2	6	1143	1148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561189
28	NC_008345	TAC	2	6	1160	1165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561189
29	NC_008345	TGG	2	6	1291	1296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561189
30	NC_008345	GAA	2	6	1349	1354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561189
31	NC_008345	AGA	2	6	1369	1374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561189
32	NC_008345	TCT	2	6	1400	1405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561189
33	NC_008345	GCG	2	6	1480	1485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561190
34	NC_008345	TTA	2	6	1524	1529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561190
35	NC_008345	TCA	2	6	1545	1550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561190
36	NC_008345	TGG	2	6	1585	1590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561190
37	NC_008345	ACG	2	6	1629	1634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561190
38	NC_008345	CAGAG	2	10	1675	1684	40 %	0 %	40 %	20 %	114561190
39	NC_008345	AAC	2	6	1699	1704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561190
40	NC_008345	ATA	2	6	1708	1713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561190
41	NC_008345	CCG	2	6	1762	1767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561190
42	NC_008345	ATT	2	6	1839	1844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561190
43	NC_008345	TTA	2	6	1883	1888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561190
44	NC_008345	GGT	2	6	2024	2029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561190
45	NC_008345	GC	3	6	2037	2042	0 %	0 %	50 %	50 %	114561190
46	NC_008345	GAC	2	6	2055	2060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561190
47	NC_008345	CCATTG	2	12	2071	2082	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	114561190
48	NC_008345	CCG	2	6	2159	2164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561190
49	NC_008345	CAA	2	6	2183	2188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561190
50	NC_008345	CTATC	2	10	2239	2248	20 %	40 %	0 %	40 %	114561190
51	NC_008345	AAT	2	6	2310	2315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561190
52	NC_008345	AAG	3	9	2323	2331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561190
53	NC_008345	AGA	2	6	2333	2338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561190
54	NC_008345	ATT	2	6	2340	2345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561190
55	NC_008345	GTTA	2	8	2388	2395	25 %	50 %	25 %	0 %	114561190
56	NC_008345	AAC	2	6	2412	2417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561190
57	NC_008345	TGA	2	6	2426	2431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561190
58	NC_008345	TTGA	2	8	2469	2476	25 %	50 %	25 %	0 %	114561190
59	NC_008345	AGA	3	9	2486	2494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561190
60	NC_008345	TATG	2	8	2498	2505	25 %	50 %	25 %	0 %	114561190
61	NC_008345	CTT	2	6	2748	2753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561191
62	NC_008345	CGTT	2	8	2764	2771	0 %	50 %	25 %	25 %	114561191
63	NC_008345	AAT	2	6	2800	2805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561191
64	NC_008345	GAT	3	9	2806	2814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561191
65	NC_008345	CGT	2	6	2872	2877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561191
66	NC_008345	GTG	2	6	2885	2890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561191
67	NC_008345	TTA	2	6	2963	2968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561191
68	NC_008345	CCG	2	6	3009	3014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561191
69	NC_008345	AATC	2	8	3115	3122	50 %	25 %	0 %	25 %	114561191
70	NC_008345	CTA	2	6	3220	3225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561191
71	NC_008345	ATT	2	6	3441	3446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561191
72	NC_008345	ACA	2	6	3486	3491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561191
73	NC_008345	CGA	2	6	3519	3524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561191
74	NC_008345	CGAT	2	8	3608	3615	25 %	25 %	25 %	25 %	114561191
75	NC_008345	GCAA	2	8	3618	3625	50 %	0 %	25 %	25 %	114561191
76	NC_008345	AAC	2	6	3698	3703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561191
77	NC_008345	TTC	2	6	3735	3740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561192
78	NC_008345	TGA	2	6	3807	3812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561192
79	NC_008345	TCA	2	6	3825	3830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561192
80	NC_008345	CATT	2	8	3903	3910	25 %	50 %	0 %	25 %	114561192
81	NC_008345	GAA	2	6	3967	3972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561192
82	NC_008345	TTA	2	6	3995	4000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561192
83	NC_008345	TGA	2	6	4029	4034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561192
84	NC_008345	TGG	2	6	4053	4058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561192
85	NC_008345	AGT	2	6	4231	4236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561192
86	NC_008345	TTG	2	6	4388	4393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561192
87	NC_008345	T	6	6	4514	4519	0 %	100 %	0 %	0 %	114561192
88	NC_008345	GGT	2	6	4549	4554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561192
89	NC_008345	GTG	2	6	4574	4579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561192
90	NC_008345	A	6	6	4627	4632	100 %	0 %	0 %	0 %	114561192
91	NC_008345	TGA	2	6	4653	4658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561192
92	NC_008345	AGTGA	2	10	4744	4753	40 %	20 %	40 %	0 %	114561192
93	NC_008345	AACA	2	8	4766	4773	75 %	0 %	0 %	25 %	114561192
94	NC_008345	TTG	2	6	4829	4834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561192
95	NC_008345	TTG	2	6	4841	4846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561192
96	NC_008345	TGC	2	6	4848	4853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561192
97	NC_008345	GCG	2	6	4867	4872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561192
98	NC_008345	CGT	2	6	4894	4899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561192
99	NC_008345	GGT	2	6	4918	4923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561192
100	NC_008345	AT	4	8	4975	4982	50 %	50 %	0 %	0 %	114561192
101	NC_008345	CTG	2	6	4997	5002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561192
102	NC_008345	TTC	2	6	5045	5050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561192
103	NC_008345	AAG	2	6	5111	5116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561192
104	NC_008345	CAT	4	12	5193	5204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561192
105	NC_008345	CA	3	6	5228	5233	50 %	0 %	0 %	50 %	114561192
106	NC_008345	CTT	3	9	5253	5261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561192
107	NC_008345	TATATT	2	12	5293	5304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561192
108	NC_008345	ACC	2	6	5310	5315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561192
109	NC_008345	A	6	6	5329	5334	100 %	0 %	0 %	0 %	114561192
110	NC_008345	ATT	2	6	5494	5499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561192
111	NC_008345	TGT	2	6	5543	5548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561192
112	NC_008345	TGA	2	6	5580	5585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561192
113	NC_008345	TAT	2	6	5649	5654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561192
114	NC_008345	ACTA	2	8	5734	5741	50 %	25 %	0 %	25 %	114561192
115	NC_008345	CTT	2	6	5757	5762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561192
116	NC_008345	GAA	2	6	5821	5826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561192
117	NC_008345	GGT	2	6	5827	5832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561192
118	NC_008345	GTG	2	6	5843	5848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561192
119	NC_008345	AAG	2	6	5858	5863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561192
120	NC_008345	CTT	2	6	5871	5876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561192
121	NC_008345	TACA	2	8	5920	5927	50 %	25 %	0 %	25 %	114561192
122	NC_008345	CGT	2	6	5995	6000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561192
123	NC_008345	GCT	2	6	6031	6036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561192
124	NC_008345	CGT	2	6	6079	6084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561192
125	NC_008345	A	6	6	6251	6256	100 %	0 %	0 %	0 %	114561193
126	NC_008345	ACC	2	6	6305	6310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561193
127	NC_008345	CAA	2	6	6323	6328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561193
128	NC_008345	TTTAT	2	10	6406	6415	20 %	80 %	0 %	0 %	114561193
129	NC_008345	TCCA	2	8	6433	6440	25 %	25 %	0 %	50 %	114561193
130	NC_008345	AAT	2	6	6461	6466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561193
131	NC_008345	A	6	6	6569	6574	100 %	0 %	0 %	0 %	114561193
132	NC_008345	CGA	2	6	6580	6585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561193
133	NC_008345	TAC	2	6	6609	6614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561193
134	NC_008345	TGT	2	6	6633	6638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561193
135	NC_008345	GT	3	6	6637	6642	0 %	50 %	50 %	0 %	114561193
136	NC_008345	CAA	2	6	6707	6712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561193
137	NC_008345	CAA	2	6	6734	6739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561193
138	NC_008345	TTA	2	6	6750	6755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561193
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170	NC_008345	CTT	2	6	8756	8761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561194
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261	NC_008345	TA	3	6	14047	14052	50 %	50 %	0 %	0 %	114561197
262	NC_008345	TCC	2	6	14099	14104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114561197
263	NC_008345	TAA	2	6	14132	14137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561197
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265	NC_008345	TG	3	6	14739	14744	0 %	50 %	50 %	0 %	114561198
266	NC_008345	CCATTT	2	12	14747	14758	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	114561198
267	NC_008345	T	7	7	14756	14762	0 %	100 %	0 %	0 %	114561198
268	NC_008345	ATT	2	6	14815	14820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561198
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272	NC_008345	T	6	6	15093	15098	0 %	100 %	0 %	0 %	114561199
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366	NC_008345	TGGCT	2	10	20075	20084	0 %	40 %	40 %	20 %	114561202
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380	NC_008345	ATT	2	6	20615	20620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561203
381	NC_008345	GAT	2	6	20674	20679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561203
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384	NC_008345	TTG	2	6	20924	20929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561203
385	NC_008345	ATG	2	6	20936	20941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561203
386	NC_008345	ATT	2	6	21164	21169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561204
387	NC_008345	ATT	2	6	21193	21198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561204
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389	NC_008345	TA	3	6	21237	21242	50 %	50 %	0 %	0 %	114561204
390	NC_008345	TGG	3	9	21247	21255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561204
391	NC_008345	T	6	6	21275	21280	0 %	100 %	0 %	0 %	114561204
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393	NC_008345	GTT	2	6	21370	21375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561204
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